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NEWS尊龙凯时细菌基因组DNA提取实验准备
来源:尹茗悦 日期:2025-03-02在生物医疗领域,提取细菌基因组DNA是一项至关重要的实验步骤。在经过细菌培养与收集之后,我们已经获得了足够数量的菌体。接下来,我们进入了实验的关键步骤——细胞裂解。这一过程的目的是打破细菌的细胞壁和细胞膜,从而释放出其中的DNA。为此,我们采用化学与物理相结合的策略,首先使用特定的酶类处理样品,这些酶能特异性降解细菌的细胞壁成分,随后使用超声波或法式压碎法进一步打破细胞,以确保DNA的充分释放。
完成细胞裂解后,我们面临着有效分离和纯化DNA的挑战。此时,利用DNA在不同盐浓度和pH值下的溶解度差异,通过一系列有机溶剂抽提步骤,可以有效去除杂质如蛋白质和多糖,同时保护DNA免受降解。在这一过程中,每一步操作都需谨慎,避免剧烈振荡,以防止DNA断裂。
1. 说明书,耗材:DNA制备管,小量滤器,2ml离心管,15ml离心管。
2. RNaseA:50mg/ml,室温保存。
3. *:50%甘油溶解*,使*浓度为50mg/ml,-20℃密闭储存。
4. BufferS:细菌原生质制备液,加入RNaseA后,4℃密闭储存。
5. 025MEDTA:室温密闭储存。
6. BufferG-A:裂解液,室温密闭储存。
7. BufferG-B:蛋白去除液,室温密闭储存。
8. BufferDV-A:BufferDV的制备液,根据实验准备方法配制,室温密闭储存。
9. BufferDV:相分离液,室温密闭储存。
10. BufferBV:DNA结合液,室温密闭储存。
11. BufferW1:洗涤液,室温密闭储存。
12. BufferW2concentrate:去盐液。使用前按试剂瓶上的体积添加无水乙醇并混合均匀,室温密闭储存。可用100%乙醇或95%乙醇。
13. Eluent:25mM Tris-HCl,pH8.5,室温密闭储存。
1. 首次使用时,在BufferW2中按试剂瓶上的体积加入无水乙醇并混合均匀。
2. 准备BufferDV:取2ml BufferDV-A,125ml异丙醇,75ml,加入提供的250ml试剂瓶中,混合均匀。
3. 将BufferDV预冷至4℃。
4. 根据使用次数,需用50%甘油溶解*,使*浓度为50mg/ml。
5. 每次使用试剂盒时将随试剂盒携带的RNaseA全部加入BufferS中,混合均匀。
6. 准备65℃水浴。
7. 检查BufferG-A和BufferG-B是否出现沉淀,如有沉淀请于65℃水浴加热至沉淀完全溶解后再使用。
8. 将Eluent或去离子水加热至65℃以促进基因组DNA的充分洗脱。
1. 用2ml离心管收集10×109(1ml菌液OD600为1-1.5)的细菌培养物,12000×g离心30s,弃尽上清,并用150μl已加入RNaseA的BufferS悬浮沉淀。2. 确认RNaseA已加入BufferS中,均匀悬浮悬液,确保没有小的菌块,以免影响后续的溶菌效果。3. 加入20μl *贮存液,混合均匀,室温静置5分钟。4. 加入30μl 025MEDTA(pH8.0),混合均匀,冰浴5分钟。5. 加入450μl BufferG-A,旋涡振荡15秒,65℃水浴10分钟。6. 加入400μl BufferG-B和1ml BufferDV(4℃预冷),用力混合,12000×g离心2分钟。7. 尽可能丢弃上相,保留相间沉淀和下相。加入1ml 4℃预冷的BufferDV,并用力混合,12000×g离心2分钟。8. 丢弃上相,将下相转移至滤器(滤器置于2ml离心管中),12000×g离心1分钟。
在以上步骤中,务必确保在BufferW2concentrate中已按试剂瓶的要求添加无水乙醇,并进行多次冲洗以去除盐分。这一重要步骤能够有效提高 DNA 的纯度,为后续的基因组分析奠定坚实的基础。
最后,通过乙醇沉淀法将提纯的DNA从溶液中析出,并在低温下进行,以促进DNA的凝聚和沉淀。沉淀物经过离心收集后,用70%乙醇清洗,以去除残留的盐分和有机溶剂,这一环节确保了DNA的纯度。最终,将洗涤后的DNA沉淀晾干并溶解于TE缓冲液中,也就是我们所说的优质细菌基因组DNA溶液。通过电泳检测,可以直观地观察到DNA条带的清晰度和完整性,进而评估提取效果。
正是通过确保每个步骤的严谨和准确,尊龙凯时为生物医疗研究提供了稳定可靠的DNA提取解决方案,推动着科学探索的进程。
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